賽默飛ABI Ion GeneStudio S5基因測序儀主要性能
• 無需復雜的光路系統(tǒng), Ion Torrent半導體測序技術利用天然核苷酸反應, 實現(xiàn)高精度的變異捕獲、 極其均一的覆蓋度以及高度的檢測靈敏度來探測低頻變異。
• 相比市場上其他基于光學檢測技術的測序平臺, IonS5系統(tǒng)幫助希望引入新一代測序技術的實驗室降低初期投入成本。
• 支持多種不同價格和通量的半導體芯片(Ion 510™、Ion 520™、 Ion 530™和Ion 540™芯片), 從而為用戶開展各類DNA/RNA測序應用項目提供更大的靈活性。
• 提供快的新一代測序儀運行速度。
• 依托用戶與技術開發(fā)者社區(qū)-Ion社區(qū)(IonCommunity)-這一社區(qū)目前已擁有超過3萬名會員,會員人數(shù)仍在每天增長中。
• 較小的桌面占用空間, 僅需不到0.5平方米 (儀器尺寸:54.2 x 80.6 x 50.9 cm) 。
• 提供廣泛的文庫制備方案與試劑盒選擇, 操作簡單、快速, 起始樣品需求量極低, 適用于微生物測序、靶向基因測序、 外顯子組測序, 以及RNA測序等廣泛研究應用。
• 與Ion Chef™系統(tǒng)或Ion OneTouch™ 2系統(tǒng)配合使用, 實現(xiàn)簡易快速的模板制備。
• 通過整合的T630服務器與Torrent Suite™軟件, 實現(xiàn)從堿基識別到變異解析的完整解決方案。
• 運用Ion Reporter™軟件對配對樣品DNA變異的檢測和分析, 提供簡易和整合的三級數(shù)據(jù)分析工具。
賽默飛ABI Ion GeneStudio S5基因測序儀技術參數(shù)與應用
性能 | 描述 |
簡捷的靶向測序流程 | "簡單、 快速的自動化工作流程: 靶向測序應用中, 從DNA樣品輸入到獲 得分析數(shù)據(jù)*的完整過程中手工操作不到45分鐘" |
• 文庫制備: – Ion Xpress Plus片段文庫試劑盒: 15分鐘(手工操作時間) – 使用AB Library Builder實驗方案實現(xiàn)自動化文庫制備(13份樣品): 10分鐘(手工操作時間) – Ion AmpliSeq靶向富集和建庫技術: • 手動建庫方案: 60分鐘(手工操作時間) • Ion Chef系統(tǒng)自動化建庫方案: 15分鐘(手工操作時間) • 模板制備: – Ion OneTouch 2系統(tǒng): 模板擴增, 手工操作時間2.5小時 – Ion Chef系統(tǒng): 模板擴增與芯片上樣, 手工操作時間15分鐘 • 測序: – 手工操作時間少于15分鐘 • 數(shù)據(jù)分析: – 從5百萬讀值數(shù)據(jù)(200 bp測序反應)獲得比對好的BAM文件, 操作時間不到5小時" | |
快速的新一代測序 | 從DNA樣品到獲得變異結果快僅需兩個工作日(8小時計算) |
• 測序反應僅需2.5-4小時即可完成
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高度靈活的通量 | 四款芯片分別提供從2百萬至8千萬的序列通量, 用戶可以根據(jù)需求靈活選擇 |
每周樣品通量高 | 每周可完成更多數(shù)量樣品的完整靶向測序工作流程 |
• 模塊化工作流程設計, 支持用戶每周(5個工作日)進行多次測序*: 每臺Ion S5系統(tǒng)每周可完成多達10次測序(200堿基讀值) • 模塊化工作流程, 研究人員能夠在一臺Ion S5系統(tǒng)上多可同時操作384份標記樣品, 每周多可檢測3840份獨立DNA樣品 * 工作日以8小時計算。 | |
簡捷、 直觀的系統(tǒng) | 盒裝試劑與友好的用戶界面, 為用戶提供一個簡捷的測序流程 |
• 在Ion Chef系統(tǒng)、 Ion OneTouch 2系統(tǒng)和Ion S5系統(tǒng)上, 用戶可使用直觀的觸摸界面進行編程和操控 • 用戶可通過固定或移動設備(如iOS和Android設備)遠程監(jiān)控Ion S5測序儀 • 行業(yè)標準數(shù)據(jù)格式(FASTQ、 SFF、 BAM、 VCF), 兼容第三方生物信息學軟件提供的下游分析和可視化工具。 • 模塊化工作流程, 可在文庫制備到測序的每一個環(huán)節(jié)中實施質量控制, 幫助用戶節(jié)約時間, 降低試劑成本。 • 通過盒裝試劑與完整樣品跟蹤功能(RFID掃描)優(yōu)化流程, 提高效率 | |
長堿基讀長 | • 200-、 400-與600-堿基讀長 • 兼容長mate-pair讀長 |
*硬件 | 牢固而簡潔的硬件值得您信賴 |
• 設計簡單, 無冗余的活動零件或復雜的附屬系統(tǒng), 穩(wěn)健可靠 • 標準臺式系統(tǒng)(Ion S5系統(tǒng)與Ion Chef系統(tǒng)或Ion OneTouch 2系統(tǒng)), 提供完整擴增與測序工作流程 • 用戶可通過Ion S5系統(tǒng)的外置條碼閱讀器追溯芯片和樣品, 通過Ion S5 Torrent服務器實現(xiàn)樣品登記 • Ion Chef系統(tǒng)與Ion S5系統(tǒng)采用了優(yōu)的識別系統(tǒng), 對編碼耗材進行識別和追蹤, 并將信息集成至Torrent Suite軟件和/或LIMS系統(tǒng) • 所有Ion S5系統(tǒng)均由符合ISO 13485標準的工廠生產(chǎn) | |
緊湊型臺式系統(tǒng) | Ion S5 XL系統(tǒng)僅占用很小的桌面空間 |
• 尺寸(W x D x L) (近似值): 21.4 x 31.75 x 20 in. (54.2 x 80.6 x 50.9 cm) • 占用面積: 4.72 平方英尺 • 重量(近似值): 140 lb/63.5 kg | |
提供完整產(chǎn)品組合 | 高性價比的新一代測序平臺, 廣泛適用于各類DNA與RNA研究應用 |
低序列偏性 | 高度均一的覆蓋度及精確的變異檢測 |
• Ion 510/520/530 Kit-Chef與Ion 520/530 Kit-OT2能夠對200和400堿基文庫進行精確、 可靠的測序 • Ion 540 Kit-Chef與Ion 540 Kit-OT2能夠對200堿基文庫進行精確、 可靠的測序 • Ion 520/530 ExT Kit-Chef能夠對600堿基文庫進行精確、 可靠的測序 • 通過簡單的天然化學反應過程獲得均一的覆蓋度(即無偏性) • 基于天然核苷酸, 聚合酶或核苷酸上無附著的熒光基團, 從而實現(xiàn)長堿基讀長和堿基識別的高保真度 |