ECO板

物學家挑選的用于微生物群落分析常用的31種碳源，是國際上微生物生態(tài)功能多樣性研究的較典型和方法之一。 每塊96孔ECO板上有3組平行，每組31種碳源，3個陰性對照，加入同一樣品后，可以獲得3組平行數(shù)據(jù)。微生物群落對這31種碳源的特征性利用稱作該微生物群落的代謝指紋圖譜。從單個的微平板上的指紋圖譜就可以獲得大量的代謝信息?？捎糜诩兎N及混合菌群(如土壤樣品)微生物功能多樣性研究。

美國BIOLOG公司研發(fā)的產(chǎn)品 ECO板，特別為微生物群落分析和生態(tài)研究設計，Eco板上包含國際土壤微生物學家精選的用于微生物群落分析常用的31種碳源。

每塊96孔ECO板上有3組平行，每組31種碳源，3個陰性對照，加入同一樣品后，可以獲得3組平行數(shù)據(jù)。微生物群落對這31種碳源的特征性利用稱作該微生物群落的代謝指紋圖譜。從單個的微平板上的指紋圖譜就可以獲得大量的代謝信息?？捎糜诩兎N及混合菌群(如土壤樣品)微生物功能多樣性研究。

31種碳源可分為六大類，具體如下：

單糖/糖苷/聚合糖類

B2， D-木糖

H1, a-D-乳糖

A2, ?-甲基D-葡萄糖苷

G2,葡萄糖-1-磷酸鹽

E1, a-環(huán)狀糊精

F1, 肝糖

G1, D-纖維二糖

氨基酸類，

A4，L-精氨酸，

B4，L-天冬酰胺酸

C4 L-苯基丙氨酸

D4, L-絲氨酸

E4，L-蘇氨酸

F4，甘氨酰-L-谷氨酸

酯類

B1, 丙酮酸甲酯

C1, 吐溫40

D1, 吐溫80

A3, D-半乳糖酸γ內(nèi)酯

醇類

C2, I-赤藻糖醇

D2, D-甘露醇

H2, D,L-a-甘油

胺類

G4, 苯乙基胺

H4, 腐胺

E2, N-乙?；?D-葡萄胺

酸類

B3,D-半乳糖醛酸

F2 D-氨基葡萄糖酸

C3, 2-羥苯甲酸

D3, 4-羥基苯甲酸

E3,r-羥基丁酸

F3, 衣康酸

G3,a-丁酮酸

H3, D-蘋果酸

樣品簡單處理后(過濾或離心)，取上清液加到ECO板上培養(yǎng)多至5天時間，每隔一定時間用酶標儀在590nm和750nm下測定OD值，OD值的大小反應樣品微生物利用某一碳源底物的能力，將OD值導出后進行分析，如AWCD值(平均吸光度)、豐富度、單孔的動力學分析、不同類碳源的比較等，并可用聚類軟件對不同樣品進行聚類分析。

值得一提的是ECO板不僅測定可培養(yǎng)微生物，還可測定部分不可培養(yǎng)微生物，只要微生物能利用碳源進行代謝(并不增殖)，ECO板上顯色體系均可檢測出來。

較常見的應用是利用ECO板分析環(huán)境因素、根系、葉面、肥料、農(nóng)藥對土壤微生物菌群的生態(tài)功能多樣性的影響，比較不同樣品間或同一樣品不同時間的功能多樣性差異，比較環(huán)境修復前后微生物群落的功能多樣性差異，等等。