詳細(xì)介紹
發(fā)現(xiàn)Ion Torrent
Ion Torrent, 個(gè)人化操作基因組測(cè)序儀(PGM™), 是市場(chǎng)上相較其他測(cè)序技術(shù),更簡(jiǎn)單,經(jīng)濟(jì)和具有強(qiáng)大的可擴(kuò)展性的測(cè)序平臺(tái)。PGM™臺(tái)式系統(tǒng)的設(shè)計(jì)配合革新性的半導(dǎo)體芯片技術(shù),使整個(gè)平臺(tái)具有的擴(kuò)展性和快速完成測(cè)序的性能。
Ion Torrent 技術(shù)通過(guò)專有的大規(guī)模并行半導(dǎo)體感應(yīng)器,對(duì)于DNA 擴(kuò)增時(shí)產(chǎn)生的離子流,實(shí)現(xiàn)直接和實(shí)時(shí)的檢測(cè)。當(dāng)試劑通過(guò)集成的流體通路進(jìn)入Ion Torrent半導(dǎo)體芯片中,密布于芯片上的反應(yīng)孔立即成為上百萬(wàn)個(gè)微反應(yīng)體系。這種的流體體系,微體系機(jī)械設(shè)計(jì)和半導(dǎo)體的技術(shù)組合,使我們得以快速直接的將遺傳信息翻譯成數(shù)碼的DNA測(cè)序結(jié)果,得到大量高質(zhì)量的測(cè)序數(shù)據(jù)。
個(gè)人化操作基因組測(cè)序儀,配合Ion Torrent的半導(dǎo)體芯片,反應(yīng)試劑盒和計(jì)算機(jī)服務(wù)器,數(shù)據(jù)分析套件,提供您的測(cè)序解決方案。
發(fā)現(xiàn)‘擴(kuò)展’
比擬半導(dǎo)體技術(shù)升級(jí)的強(qiáng)大擴(kuò)展性
• 技術(shù)的基礎(chǔ)以超過(guò)千億美金規(guī)模的半導(dǎo)體產(chǎn)業(yè)為支持
• 芯片密度的提升以40年來(lái)累積驗(yàn)證的摩爾定律為證據(jù)
• 芯片產(chǎn)量的擴(kuò)展以四百家標(biāo)準(zhǔn)化半導(dǎo)體生產(chǎn)企業(yè)為選擇
發(fā)現(xiàn)‘簡(jiǎn)捷’
簡(jiǎn)單真實(shí)的生物化學(xué)原理
• 真實(shí)的離子流測(cè)序原理
• 飾的核酸,無(wú)需酶化學(xué)級(jí)聯(lián),無(wú)需任何熒光和化學(xué)發(fā)光
• 經(jīng)濟(jì)的標(biāo)準(zhǔn)試劑
發(fā)現(xiàn)‘快速’
發(fā)現(xiàn)‘快速’
直接,實(shí)時(shí)的測(cè)序技術(shù)
• 實(shí)現(xiàn)更多的研究和市場(chǎng)應(yīng)用
• 快速的運(yùn)行時(shí)間提速研究周期和文章的發(fā)表
• 革新性的半導(dǎo)體測(cè)序芯片,無(wú)需光學(xué)檢測(cè)和掃描
測(cè)序和分析流程
Ion Torrent 測(cè)序流程標(biāo)準(zhǔn)的要素包括,從準(zhǔn)備隨機(jī)片段的DNA 文庫(kù)或者擴(kuò)增子文庫(kù),到樣本的PCR 擴(kuò)增和在PGM™的測(cè)序運(yùn)行。
完成整個(gè)PGM™的測(cè)序運(yùn)行后,數(shù)據(jù)將會(huì)自動(dòng)的導(dǎo)入專用的Torrent 預(yù)裝分析套件的計(jì)算機(jī)服務(wù)器。在這里,原始的測(cè)序信號(hào)會(huì)轉(zhuǎn)化成堿基序列并且以工業(yè)標(biāo)準(zhǔn)的SFF或者FASTAQ格式存儲(chǔ)起來(lái)。這些測(cè)序數(shù)據(jù)可以通過(guò)眾多商業(yè)化的軟件進(jìn)行后續(xù)不同應(yīng)用的分析或者全新基因組的拼接。
A. DNA/RNA 樣本
B. 相應(yīng)的文庫(kù)準(zhǔn)備
C. 測(cè)序樣本準(zhǔn)備
D. 測(cè)序反應(yīng)
E. FASTQ 數(shù)據(jù)格式的測(cè)序結(jié)果
Torrent 數(shù)據(jù)分析軟件
Ion Torrent PGM 到 Torrent 服務(wù)器和數(shù)據(jù)庫(kù) 到終端用戶電腦
Ion 314 測(cè)序芯片
芯片規(guī)模: | 130萬(wàn)個(gè)反應(yīng)微孔 |
數(shù)據(jù)輸出: | 以超過(guò)1千萬(wàn)高質(zhì)量測(cè)序數(shù)據(jù)為起始 |
測(cè)序長(zhǎng)度: | 以100個(gè)堿基為起始 |
數(shù)據(jù)格式: | SFF/FASTQ 數(shù)據(jù)格式 |
試劑: | 314 芯片試劑套裝,包括文庫(kù),樣本和測(cè)序試劑 |
應(yīng)用: | 微生物基因組測(cè)序和重測(cè)序,靶標(biāo)(擴(kuò)增子)區(qū)域重測(cè)序 |